Huuhtanen aloitti jalkapallouransa Tampereen Ilveksen juniorijoukkueissa. Hän debytoi Ilveksen edustusjoukkueessa Veikkausliigassa kaudella 2020, pelaten yhteensä 10 liigaottelua seuran paidassa. Tammikuussa 2023 Huuhtanen siirtyi FC Interiin kaksivuotisella sopimuksella. Kaudella 2023 hän vakiinnutti paikkansa joukkueen ykkösmaalivahtina, pelaten 25 ottelua Veikkausliigassa. Elokuussa 2024 Huuhtanen solmi FC Interin kanssa jatkosopimuksen, joka ulottuu kauden 2025 loppuun, sisältäen option kaudesta 2026. Kausi 2025 oli Eetulta läpimurto Veikkausliigan eliittiin, sillä hän pelasi kaikki ottelut liigassa vähiten maaleja päästäneen Inter-puolustuksen lukkona. Huikea kausi palkittiin valinnalla Veikkausliigan parhaaksi maalivahdiksi. Maajoukkuetasolla Huuhtanen on edustanut Suomea U19- ja U21-joukkueissa. Hän debytoi U21-maajoukkueessa kesäkuussa 2023.
