Uransa miesten tasolla ranskalaisessa Bordeaux’ssa aloittanut Faubert on pelannut Ranskan pääsarjassa kaikkiaan 144 ottelua ja hän on pelannut joukkueessa myös Mestarien liigan lohkovaiheessa. Kaudeksi 2007 Englannin Valioliigan West Hamiin siirtynyt Faubert pelasi joukkueessa kaikkiaan 69 Valioliigan ottelua ja 36 mestaruussarjan ottelua. Lisäksi kevään 2009 Faubert pelasi Espanjan suurseura Real Madridissa. West Hamista vuonna 2012 lähtenyt Faubert on pelannut myös Turkin liigan Elazigsporissa, uudelleen Bordeaux’ssa ja viime vuonna Kilmarnockissa.
Faubert on pelannut urallaan pääasiassa oikean laidan rooleissa ja keskikentän pohjalla. Le Havresta kotoisin oleva pelaaja on edustanut maajoukkuetasolla sekä Ranskaa että myöhemmin Martiniqueta, jossa hänellä on sukujuuria.